在游戏上，虽然1代和2代没有太大的联系，但剧情上有巨大的关联。人物没有变，只加入了一个机器人，同时2代玩法上加入了一些特别的涂料等元素。
在1代中，女主角被抓去测试传送枪，并有一个AI助她通关。然而测试完成后，这个AI（GaLDos）叛变，并试杀害女主角。玩家需要击败她并逃脱公司。2代中，女主角再次被抓去测试传送门并接受了更多挑战，然而这一次她又得到了一些帮助。其中一个男版AI（whitney）协助她打败GaLDos，揭示出其核心竟是一个土豆。然后AI男控制了基地，反过来又要攻击女主角。此时玩家找到了GaLDos的土豆，答应帮助她。GaLDos承诺会将控制权交还后放走女主角。最终，玩家打败了AI男whitney，并被GaLDos释放。
背景故事是，Johnson Cave创立了光圈科技，并发明了传送门。他和助手Caroline一同致力于科技发展。然而Cave去世后，Caroline继承了他的事业。之后，Caroline将自己的记忆和遗愿移植到GaLDos中。由于公司员工已经不在，GaLDos继续测试并运营着传送门。
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